История журнала Океанологические исследования началась с создания Национального геофизического комитета во время проведения Международного геофизического года 1957-1958 гг. Международные полярные года проводились раньше в 1882—1883 и в 1932—1933 гг. Предложение провести Международный геофизический год исходило от Международного геодезического и геофизического союза (International Union of Geodesy and Geophysics).

В составе Комитета были образованы секции:

Геомагнетизма
Гляциологии
Гравиметрии
Долгот и широт
Ионосферы
Метеоров
Метеорологии и физики атмосферы
Океанографии
Планетарной геофизики
Полярных сияний
Ракет и искусственных спутников Земли
                                            Сейсмологии
                                            Солнечной активности и космических лучей

Практически каждая секция основала свой журнал. В 1959 году секция океанографии опубликовала журнал «Океанологические исследования». Главным редактором всей серии был избран член-корреспондент АН СССР Ю.Д. Буланже. Редакционную работу редакторов возглавил Б.И Силкин.

Первые выпуски "Океанологических исследований" были посвящены результатам Международного геофизического года. Ответственными редакторами выпусков журнала по линии Междуведомственного геофизического комитета всегда были ученые секретари секций. Ответственным редактором первых номеров, посвященных результатам работы Международного геофизического года стал один из основателей Института океанологии, известный океанолог Н.Н. Сысоев. Затем до 1972 г. журнал выпускался под руководством И.М. Белоусова. Выпуски журнала начала 1970 годов посвящались эксперименту «Полигон-70», затем исследованиям западных пограничных течений в Атлантике. Ученым Секретарем Секции с 1972 по 1976 гг. был Р.П. Булатов. С 1976 по 1988 г. Ученым Секретарем был Е.Г. Морозов. Большое количество выпусков, начиная с № 30 в 1979 году, было посвящено результатам Советско-американского эксперимента «ПОЛИМОДЕ». Все выпуски журнала были, как правило, посвящены результатам исследований по международным проектам. Выпуски "Океанологических исследований" закончились в 1993 г. последним 44-м томом.

В 2017 г. Институт океанологии им. П.П. Ширшова РАН принял решение выпускать свой электронный журнал. По согласованию с Национальным геофизическим комитетом РАН было решено продолжить выпуски "Океанологических исследований", то есть выпускать новый электронный журнал, продолжая серию ранних публикаций. Первый и единственный номер 45 тома за 2017 год вышел в декабре 2017 года.